Edward Malak pracował w Politechnice Warszawskiej i Polskiej Akademii Nauk.
W 1986 r. obronił dysertację doktorską w Instytucie Historycznym Uniwersytetu Wrocławskiego nt. samolotów bojowych i zakładów lotniczych w Polsce w latach 1933 - 1939.
W 2005 r. habilitował się w Instytucie Historii Nauki PAN na podstawie pracy pt. "Administrowanie w lotnictwie polskim 1926-1939 mieniem państwowym w warunkach postępu technicznego".

W latach 1993-1998 gruntownie przebudował Zakład Narodowy im. Ossolińskich - Wydawnictwo, infrastrukturę, program wydawniczy oraz doprowadził do jego znacznego oddłużenia. Następnie w Warszawie ratował Ośrodek Rozpowszechniania Wydawnictw Naukowych (ORWN PAN).

Jest autorem książek poświęconych historii lotnictwa